El almacén frigorífico dispone de tres registros sanitarios: 12.07862/V para pesca y acuicultura, tanto para productos refrigerados como congelados, 40.03584/V para todo tipo de productos envasados y 10.09018/V para productos cárnicos. Además Silomar cuenta con la Autorización de Sanidad Exterior para almacenaje de mercancías inmovilizadas en espera de resultados analíticos de metales pesados.